من اهم مهام هذه الشعبة
- اعداد الدراسات الهيدروجيولوجية والهيدروكيميائية للاحواض المائية الاقليمية والموقعية.
- اعداد وتحديث الخرائط الهيدروجيولوجية والهيدروكيميائية للعراق وبمقاييس مختلفة.
- اعداد الدراسات الخاصة لخفض مناسيب المياه الجوفية للمدن والمواقع الصناعية والاثارية.
- دراسة معالجة التخسفات الناتجة من فعل المياه الجوفية للمنشأت الصناعية والابنية بالاشتراك مع الاقسام ذات العلاقة .
- القيام بدراسات هيدروجيولوجية لاغراض الخزن الجوفي، وتحليل المناطق الواعدة وهذا من حيث كمية المياه ونوعيتها في الخرانات المائية.
- اعداد الدراسات الخاصة في تحديد تلوث المياه السطحية و الجوفية من خلال اختلاف التراكيز للعناصر الرئيسة والثانوية، وبيان الحلول اللازمة لتلافي هذا التلوث.
- توفير المياه الجوفية من خلال حفر الابار المائية للقطاعين العام والخاص وللاغراض المختلفة.
- اعداد الدراسات الخاصة بأختيار مواقع السدود والخزانات المائية ومحطات الكهرباء.
- تحديد المعاملات الهيدروليكية للخزانات المائية ومن خلال فحوصات الضخ والسكب لتحديد مواصفات الخزانات المائية وكفائتها.
- تحديد نوعية المياه الجوفية في الخزانات المائية ومدى ملائمتها للاستخدامات المختلفة وتحديد كمياتها واعماقها.